> Sekvenace > Standardní sekvenace

Česky | Slovensky | English | Polski

Standardní sekvenace

Standardní sekvenace zahrnuje sekvenaci DNA zaklonované do plasmidového vektoru nebo sekvenaci PCR produktu. Plasmidy sekvenujeme univerzálními primery (uvedenými v seznamu) i primery, které dodá zákazník. K sekvenaci PCR produktu používáme amplifikační primery zaslané zákazníkem. V případě specifických požadavků primery sami navrhneme a nasyntetizujeme.

 

Cena

 

Dodací podmínky

Výsledky odesíláme buď e-mailem nebo poštou na CD do 5 pracovních dnů od obdržení objednávky.

Zákazník obdrží sekvence ve formě scf souborů s přehledným souhrnem výsledků v tabulce (tzv. sekvenační klíč). Scf soubory lze prohlížet a upravovat pomocí aplikací volně dostupných na internetu, např.:

http://www.geospiza.com/Products/finchtv.shtml
http://www.technelysium.com.au/chromas_lite.html

 

Způsob objednání

Objednávku standardní sekvenace můžete zaslat na e-mailovou adresu s uvedením hesla SEQ do předmětu e-mailu. Vyplněný objednávkový formulář můžete také vytisknout a odeslat poštou spolu se vzorky (případně i s primery) na naši adresu. (Pokud jde o doobjednávku sekvenace vzorku, který jsme již obdrželi v rámci předchozí zakázky, stačí vyplněný objednávkový formulář odeslat na zmíněnou e-mailovou adresu s uvedením této skutečnosti.)

Další informace získáte na výše uvedené e-mailové adrese nebo na telefonu +420 495 056 394.

 

Požadavky na materiál

  • Sekvenace plasmidové DNA:

- čistota (A260/280) alespoň 1,8
- minimální množství DNA do 1 sekvenační reakce 150-300 ng (ideální koncentrace ≥ 100 ng/µl)
- množství primeru do 1 sekvenační reakce 8 pmol

Koncentraci a čistotu plasmidu lze zjistit spektrofotometricky.

  • Sekvenace PCR produktu:

- vzorek přečištěný purifikačním kitem
- minimální množství DNA do 1 sekvenační reakce 20-50 ng
- množství primeru do 1 sekvenační reakce 12 pmol

Kvalitu i množství PCR produktu by měl zákazník ověřit pomocí elektroforézy. Fotografii a údaje o elektroforéze můžete vložit do objednávkového formuláře. O vstupní kvalitě PCR produktu se také můžete informovat v požadavcích na kvalitu PCR produktu.

  • Sekvenační primery zaslané zákazníkem by měly splňovat následující parametry:

- Tm ≥ 50 °C (ideální Tm mezi 50-60 °C)
- délka 18-25 bazí
- obsah GC bazí 30-70 %
- neměly by tvořit žádné silné dimery a vlásenky