> Sekvenace > Standardní sekvenace

Česky | Slovensky | English | Polski

Standardní sekvenace

Standardní sekvenace zahrnuje sekvenaci DNA zaklonované do plasmidového vektoru nebo sekvenaci PCR produktu. Plasmidy sekvenujeme univerzálními primery (uvedenými v seznamu) i primery, které dodá zákazník. K sekvenaci PCR produktu používáme amplifikační primery zaslané zákazníkem. V případě specifických požadavků primery sami navrhneme a nasyntetizujeme.

 

Cena

 

Dodací podmínky

Výsledky odesíláme buď e-mailem nebo poštou na CD do 5 pracovních dnů od obdržení objednávky.

Zákazník obdrží sekvence ve formě scf souborů s přehledným souhrnem výsledků v tabulce (tzv. sekvenační klíč). Scf soubory lze prohlížet a upravovat pomocí aplikací volně dostupných na internetu, např.:

http://www.geospiza.com/Products/finchtv.shtml
http://www.technelysium.com.au/chromas_lite.html

 

Způsob objednání

Objednávku standardní sekvenace můžete zaslat na e-mailovou adresu s uvedením hesla SEQ do předmětu e-mailu. Vyplněný objednávkový formulář můžete také vytisknout a odeslat poštou spolu se vzorky (případně i s primery) na naši adresu.

Další informace získáte na výše uvedené e-mailové adrese nebo na telefonu +420 495 056 394.

 

Požadavky na materiál

Vzorky a primery připravte do zkumavek o objemu 1,5-2 ml v deionizované vodě nebo 10mM Tris pufru, ne v TE pufru.

  • Sekvenace plasmidové DNA:

- čistota (A260/280) alespoň 1,8
- minimální koncentrace DNA 100 ng/µl
- minimální objem vzorku 20 µl

Koncentraci a čistotu plasmidu lze zjistit spektrofotometricky.

  • Sekvenace PCR produktu:

1) purifikovaný vzorek

- minimální koncentrace DNA 50 ng/µl
- minimální objem vzorku 20 µl

2) nepurifikovaný vzorek

- minimální koncentrace DNA 100 ng/µl
- minimální objem vzorku 30 µl

Kvalitu i množství PCR produktu ověřte pomocí elektroforézy. Fotografii a údaje o elektroforéze vložte do objednávkového formuláře. O vstupní kvalitě PCR produktu se také můžete informovat v požadavcích na kvalitu PCR produktu.

  • Sekvenační primery zaslané zákazníkem by měly splňovat následující parametry:

- minimální koncentrace primeru 10 pmol/µl
- minimální objem primeru 20 µl (toto množství stačí na 5 sekvenačních reakcí)
- Tm ≥ 50 °C (ideální Tm mezi 50-60 °C)
- délka 18-25 bazí
- obsah GC bazí 30-70 %
- neměly by tvořit žádné silné dimery a vlásenky