O oligách

Univerzální baze je modifikovaná nukleobaze, která se dokáže nespecificky párovat s více než jednou ze čtyř standardních bazí DNA (adeninem – A, thyminem – T, guaninem – G a cytosinem – C). Ideální univerzální baze by měla tuto schopnost vykazovat bez významného snížení stability DNA dupletu a bez interference s aktivitou DNA polymeráz. Nejběžněji používanou

Degenerovaná baze „N“ a univerzální baze inosin (I) obě slouží k zavedení bazové nejednoznačnosti (ambiguity) při syntéze oligonukleotidů. Tyto dva přístupy však fungují na odlišných principech a používají se v různých experimen­tálních kontextech.   Inosin (I) vs. degenerovaná baze „N“  Vlastnost Inosin (I) Degenerovaná baze „N“ Chemická identita Jediný, chemicky definovaný modifikovaný nukleotid Směs čtyř

Degenerované baze, jako dK a dP, představují syntetické, nestandardní nukleobaze používané v molekulární biologii, zejména při syntéze oligonukleotidů, s cílem umožnit degenerované (ambiguózní) párování bazí. Tyto baze slouží jako alternativy ke klasické degenerované bazi „N“, která představuje směs čtyř standardních bází (A, T, G, C), avšak systém dK/dP umožňuje vyšší kontrolu a lepší výkonnost v

Definice a charakteristika Analoga bazí představují chemicky upravené varianty přirozených nukleotidů – adeninu (A), cytosinu (C), guaninu (G) a thyminu (T) – které si zachovávají schopnost komplementárního párování, avšak vykazují specifické chemické a strukturální vlastnosti. V sekvenačních postupech mohou tyto modifikace minimalizovat zkreslení amplifikace, zlepšovat detekční vlastnosti prostřednictvím fluorescenčních signálů či sloužit jako markery pro

Why choose alternative dyes instead of "genuine" dyes? First, they are cheaper, and second, they can give the same results. Another reason is that the number of suppliers who can provide modified oligonucleotides is restricted - only a patent or a licence owner is usually allowed to produce them.