Novinka v portfoliu: ultramery

Běžné oligonukleotidy spolehlivě pokrývají rutinní potřeby, u složitějších experimentálních designů (příprava dlouhých kontrolních templátů, specifických sond nebo pokročilé genové manipulace) jsou mnohdy preferovány sekvence přesahující délku sta bazí. Právě pro tyto specifické laboratorní a výzkumné aplikace zařadila společnost GENERI BIOTECH do svého portfolia novinku v podobě tzv. ultramerů.

Parametry standardní syntézy

Ultramery představují cílený nástroj pro syntézu dlouhých oligonukleotidových sekvencí v rozmezí 100 až 130 bazí. Ve výchozím formátu jsou syntetizovány ve scale 40 nmol za využití standardní purifikace, právě toto nastavení poskytuje optimální rovnováhu mezi konečným výtěžkem a celkovou kvalitou syntézy.

Kontrola kvality

Ve společnosti GENERI BIOTECH je pro běžnou kontrolu kvality (QC) oligonukleotidů standardně využívána hmotnostní spektrometrie MALDI-TOF. U ultramerů se však dostáváme k  analytickému limitu přístrojového vybavení z důvodu jejich vysoké molekulové hmotnosti, jež překračuje dané detekční limity metody MALDI-TOF. Proto nelze u sekvencí delších 101 bazí a více stoprocentně garantovat výstup QC.

Flexibilita pro speciální designy

Ačkoliv standardní syntéza pokrývá délky do 130 bazí, reálné experimenty často představují specifické úpravy sekvencí na míru.

Mezi časté potřeby patří:

• Zavádění funkčních modifikací na 3′ a 5′ konce
• Specifické interní modifikace řetězce
• Odlišný syntetický scale nebo nadstandardní typy purifikace
• Extrémně dlouhé sekvence nad 130 bazí (131mery a delší)

Tyto „nestandardní“ varianty ultramerů jsou mnohdy možné realizovat po předchozím individuálním zhodnocení jejich proveditelnosti. V těchto případech probíhá odborná konzultace přímo s naším výrobním oddělením, kdy se pro zákazníka snažíme navrhnout optimální chemický postup, jež by byl v souladu s jeho požadavky s ohledem na dodržení kvality konečného produktu.

Oddělení výroby Oligo