gb GENETIC APOE
Detekční metoda:
alelická diskriminace
Kit slouží k detekci mutací rs429358 a rs7412 v genu pro APOE v lidské genomové DNA. Umožňuje určit genotypy E2, E3 a E4. Princip detekce je založen na real-time PCR s využitím fluorescenčně značených sond (alelická diskriminace).
Klinické souvislosti
Apolipoprotein E tvoří významnou strukturní složku tělísek transportujících cholesterol (VLDL, HDL) a je ligandem
buněčných receptorů zejména v mozku a játrech. Gen pro apolipoprotein E se vyskytuje ve třech alelách e2, e3 a e4,
které kódují izoformy proteinu E2, E3 a E4. Izoformy jsou charakteristické aminokyselinami na pozicích 112 a 158.
V populaci se vyskytují tři homozygotní (e2/e2, e3/e3 a e4/e4) a tři heterozygotní (e2/e3, e3/e4, e2/e4) genotypy. Alela e2 je asociována s výskytem hyperlipoproteinémie typu III. Izoforma E2, kódovaná touto alelou, má v porovnání s izoformami E3 a E4 výrazně sníženou afinitu k lipoproteinovým receptorům. Nositelé této izoformy mají zvýšenou hladinu triacylglycerolů v plazmě. Alela e4 zvyšuje hladinu LDL cholesterolu a je tak rizikovým faktorem aterosklerózy. V součinnosti s jinými faktory (kouření, konzumace alkoholu) pak zvyšuje riziko infarktu myokardu. Tato alela je v homozygotní formě také spojována se vznikem idiopatické formy Alzheimerovy choroby. Alela e2 je dávána do souvislosti se sníženým rizikem této nemoci.
Další parametry produktu
- ready-to-use assay
- pracovní rozsah kitu (vstupní konc. DNA) je 5–100 ng/μl
- součástí kitu jsou pozitivní kontroly (standardy) pro všechny tři genotypy každé z mutací a negativní kontrola
- stanovení je založeno na principu real-time PCR s dvojicí fluorescenčně značených hydrolyzačních sond (alelická diskriminace)
- detekce probíhá v kanálech FAM (wild type alela) a HEX (mutovaná alela)
Validováno pro:
ABI 7500/7500 Fast (ABI)
CFX96/96Touch (Bio-Rad)
Light Cycler 480/Cobas z480 (Roche Diagnostics)
QuantStudio 5 (Applied Biosystems)
RG 3000 (Corbett Research)
RG 6000/Q (Corbett Research/Qiagen)