Receptor pro epidermální růstový faktor (Epidermal Growth Factor Receptor – EGFR) je exprimován na buněčném povrchu a má tyrosin kinázovou aktivitu. EGFR se přes dráhy MAPK/ERK a PI3K/AKT/mTOR zapojuje do regulace buněčného cyklu. Aktivační mutace aktivují jeho kinázovou aktivitu, která pak vede k nekontrolované buněčné proliferaci.
Toho se využívá při léčbě tzv. tyrosin kinázovými inhibitory (TKI), které se vážou na ATP vazebné místo receptoru a tím inhibují aktivitu EGFR.
Nositelé aktivačního typu EGFR mutací pozitivně reagují na léčbu tyrozin kinázovými inhibitory (TKI). Nositelé rezistentního typů EGFR mutací jsou naopak vůči TKI rezistentní. Identifikace typu mutace v EGFR genu tedy umožňuje přesnější a personalizovanější přístup k léčbě onkologických onemocnění.
TKI proti EGFR se uplatňují především v léčbě plicních nádorů, zejména nemalobuněčného karcinomu plic. Avšak proti TKI se velmi rychle vyvíjí rezistence (medián 9–13 měsíců). Detekce mutací je proto vyžadována před zahájením léčby pomocí léčivých přípravků ze skupiny TKI.
Další parametry produktu
- souprava obsahuje 3 specifické assaye a Master Mix pro detekci 7 mutačních skupin EGFR genu a pro celkem 40 jednotlivých mutací
- vstupní koncentrace vzorku 8–80 ng/µl
- validita analýzy je kontrolována pomocí negativní kontroly, MUT a WT standardu a interní pozitivní kontroly (IPC), která je součástí každé assaye
- detekce probíhá ve fluorescenčních kanálech FAM, HEX, ROX a Cy5
- shodný amplifikační profil s produkty řady gb HEMO, gb GENETIC, gb PHARM
- seznam mutací detekovaných kitem gb ONCO EGFR:
č.. |
mutace |
změna sekvence |
cosmic ID |
exon |
1 |
G719A |
2156G>C |
6239 |
18 |
2 |
G719C |
2155G>T |
6253 |
3 |
G719D |
2156G>A |
18425 |
4 |
G719S |
2155G>A |
6252 |
5 |
E746_A750del (1) |
2235_2249del15 |
6223 |
19 |
6 |
E746_A750del (2) |
2236_2250del15 |
6225 |
7 |
E746_A750>QP |
2236_2248>CAAC |
13557 |
8 |
E746_T751del |
2236_2253del18 |
12728 |
9 |
E746_T751>A |
2237_2251del15 |
12678 |
10 |
E746_T751>T |
2236_2253> ACG |
– |
11 |
E746_S752>A |
2237_2254del18 |
12367 |
12 |
E746_T751>I |
2235_2252>AAT |
13551 |
13 |
E746_T751>V |
2237_2252>T |
12386 |
14 |
E746_T751>Q |
2236_2253>CAA |
22999 |
15 |
E746_S752>V |
2237_2255>T |
12384 |
16 |
E746_S752>D |
2238_2255del18 |
6220 |
17 |
E746_S752>EQ |
2238_2256>GCAA |
– |
18 |
E746_K754>EQHL |
2238_2261>GCAACATCT |
– |
19 |
L747_P753>S |
2240_2257del18 |
12370 |
20 |
L747_A750>P |
2238_2248>GC |
12422 |
21 |
L747_T751>Q |
2238_2252>GCA |
12419 |
22 |
L747_A750>P |
2239_2248TTAAGAGAAG>C |
12382 |
23 |
L747_A750>P |
2239_2250>CCC |
– |
24 |
L747_T751del (1) |
2239_2253del15 |
6254 |
25 |
L747_T751del (2) |
2240_2254del15 |
12369 |
26 |
L747_T751del (3) |
2238_2252del15 |
23571 |
27 |
L747_T751>S |
2240_2251del12 |
6210 |
28 |
L747_T751>P |
2239_2251>C |
12383 |
29 |
L747_S752del |
2239_2256del18 |
6255 |
30 |
L747_S752>Q |
2239_2256>CAA |
12403 |
31 |
L747_P753>Q |
2239_2258>CA |
12387 |
32 |
L747_K754>QL |
2239_2261>CAATT |
– |
33 |
D770_N771insG |
2310_2311insGGT |
12378 |
20 |
34 |
D770_N771insSVD |
2311_2312insGCGTGGACA |
13428 |
35 |
H773_V774insNPH |
2319_2320insAACCCCCAC |
12381 |
36 |
S768I |
2303G>T |
6241 |
37 |
T790M |
2369C>T |
6240 |
38 |
L858R |
2573T>G |
6224 |
21 |
39 |
L861Q |
2582T>A |
6213 |
40 |
L861R |
2582T>G |
12374 |