Purifikace oligo

V GENERI BIOTECH provádíme různé způsoby purifikace oligo:

  • standardní purifikaci – výsledný produkt je zbavován pouze chemických nečistot (přebytku solí a chránících skupin). Tento typ purifikace je vhodný pro oligonukleotidy do délky 40 – 50 bazí.
  • OPC purifikaci (Oligonucleotide Purification Cartridge) – výsledný produkt je zbavován kromě chemických nečistot (přebytek solí, chránící skupiny) i kratších nedosyntetizovaných řetězců. Tento typ purifikace je dostačující pro většinu standardních aplikací.
  • HPLC purifikaci – oligonukleotid je s vysokou účinností separován od veškerých nečistot a sekvencí nesprávné délky. HPLC purifikace poskytuje vysoce čistý oligonukleotid vhodný i pro nejnáročnější aplikace.
  • HPLC plus purifikaci – výsledný produkt je zbavován chemických nečistot. Tento typ purifikace je vysoce účinný pro odstranění kratších nedosyntetizovaných řetězců včetně n-1 do 10%.
  • NGS purifikaci – jedná se o kombinované odstranění nečistot vhodné pro NGS metodu s nižším rizikem cross-kontaminace

Standardní purifikace je bez příplatku, u OPC a HPLC se účtuje jeden příplatek za každý purifikovaný oligonukleotid. Příplatek je stejný pro všechny lhůty, značení nebo jiné modifikace oligo. Konkrétní ceny purifikace zjistíte pomocí oligokalkulátoru po přihlášení v zákaznickém portálu.

Pro většinu biomedicínských aplikací jako metoda PCR je dostačující standardní purifikace.

U modifikovaných oligonukleotidů, zejména s postsyntetickým značením (např. ATTO, ROX), doporučujeme zvolit purifikaci metodou OPC nebo HPLC.  Tyto metody zajišťují vyšší čistotu produktu, což je klíčové pro přesnost a spolehlivost následných aplikací. V takovém případě je také třeba počítat s nižším výtěžkem syntézy a objednat vyšší scale. Volba konkrétní purifikační metody závisí na požadavcích zákazníka a specifikaci zamýšlené aplikace.

V případě dotazů ohledně zvolení typu purifikace nás můžete kontaktovat na e-mailové adrese oligo@generi-biotech.com.

Garantované a obvyklé výtěžky jednotlivých typů purifikací (neznačené oligo)

SCALE 20 nmol garantovaný výtěžek (nmol) obvyklý výtěžek (nmol)
standardní purifikace 10 13-20
OPC purifikace 8 13-17
HPLC purifikace N/A N/A

 

SCALE 40 nmol garantovaný výtěžek (nmol) obvyklý výtěžek (nmol)
standardní purifikace 20 35-40
OPC purifikace 10 30-35
HPLC purifikace 5 10-35

 

SCALE 200 nmol garantovaný výtěžek (nmol) obvyklý výtěžek (nmol)
standardní purifikace 60 130-180
OPC purifikace 40 45-130
HPLC purifikace 20 25-100

 

SCALE 1 µmol garantovaný výtěžek (nmol) obvyklý výtěžek (nmol)
standardní purifikace 300 350-500
OPC purifikace 100 200-300
HPLC purifikace 50 100-250